Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT3O95395 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT3O95395 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCNT3O95395 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNT3O95395 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNT3O95395 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNT3O95395 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms