Protein–RNA interactions for Protein: O76090

BEST1, Bestrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST1O76090 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BEST1O76090 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST1O76090 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST1O76090 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST1O76090 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST1O76090 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST1O76090 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST1O76090 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST1O76090 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST1O76090 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST1O76090 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST1O76090 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST1O76090 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST1O76090 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST1O76090 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST1O76090 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST1O76090 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST1O76090 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST1O76090 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST1O76090 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST1O76090 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST1O76090 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST1O76090 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST1O76090 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST1O76090 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST1O76090 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST1O76090 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST1O76090 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST1O76090 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST1O76090 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST1O76090 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST1O76090 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST1O76090 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST1O76090 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST1O76090 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST1O76090 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST1O76090 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST1O76090 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST1O76090 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST1O76090 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST1O76090 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEST1O76090 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEST1O76090 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST1O76090 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEST1O76090 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEST1O76090 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEST1O76090 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEST1O76090 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEST1O76090 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEST1O76090 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST1O76090 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST1O76090 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST1O76090 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST1O76090 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST1O76090 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST1O76090 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST1O76090 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST1O76090 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST1O76090 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST1O76090 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST1O76090 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST1O76090 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST1O76090 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST1O76090 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST1O76090 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST1O76090 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST1O76090 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST1O76090 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST1O76090 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST1O76090 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST1O76090 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST1O76090 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BEST1O76090 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BEST1O76090 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST1O76090 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST1O76090 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST1O76090 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST1O76090 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST1O76090 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST1O76090 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST1O76090 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST1O76090 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms