Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIN3BO75182 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3BO75182 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms