Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1GO43497 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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