Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BQV1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BQV1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BQV1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BQV1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BQV1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BQV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BQV1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BQV1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BQV1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H3BQV1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H3BQV1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H3BQV1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BQV1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BQV1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BQV1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BQV1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BQV1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BQV1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BQV1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
H3BQV1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BQV1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BQV1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BQV1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BQV1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BQV1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BQV1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BQV1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BQV1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQV1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQV1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQV1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQV1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQV1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQV1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQV1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQV1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQV1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQV1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQV1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQV1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQV1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQV1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BQV1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BQV1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BQV1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BQV1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BQV1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BQV1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BQV1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BQV1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BQV1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BQV1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BQV1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BQV1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BQV1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BQV1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BQV1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BQV1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BQV1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BQV1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BQV1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BQV1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BQV1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BQV1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQV1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQV1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H3BQV1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H3BQV1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H3BQV1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H3BQV1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H3BQV1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H3BQV1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
H3BQV1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BQV1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BQV1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BQV1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BQV1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BQV1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BQV1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms