Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LEMD3Q9Y2U8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LEMD3Q9Y2U8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LEMD3Q9Y2U8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms