Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1BQ9UEU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTI1BQ9UEU0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.3 ms