Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCF3Q9NUQ8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCF3Q9NUQ8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCF3Q9NUQ8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms