Protein–RNA interactions for Protein: Q9H305

CDIP1, Cell death-inducing p53-target protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIP1Q9H305 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDIP1Q9H305 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDIP1Q9H305 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms