Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF4Q9BSR8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIPF4Q9BSR8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms