Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01600Q96MT4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms