Protein–RNA interactions for Protein: Q96HG1

SMIM10, Small integral membrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10Q96HG1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM10Q96HG1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms