Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC47Q96A33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC47Q96A33 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC47Q96A33 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms