Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF3Q8N9W5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF3Q8N9W5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAAF3Q8N9W5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms