Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NECAB1Q8N987 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECAB1Q8N987 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms