Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KRT28Q7Z3Y7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KRT28Q7Z3Y7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KRT28Q7Z3Y7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
KRT28Q7Z3Y7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KRT28Q7Z3Y7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms