Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXD4L3Q6VB84 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXD4L3Q6VB84 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD4L3Q6VB84 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms