Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
EFCAB2Q5VUJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
EFCAB2Q5VUJ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms