Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C10orf55Q5SWW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C10orf55Q5SWW7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C10orf55Q5SWW7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C10orf55Q5SWW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms