Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL39P5Q59GN2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms