Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FHOD3Q2V2M9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FHOD3Q2V2M9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
FHOD3Q2V2M9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
FHOD3Q2V2M9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms