Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC27Q2M243 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC27Q2M243 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms