Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GEN1Q17RS7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GEN1Q17RS7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GEN1Q17RS7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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