Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF56Q15929 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF56Q15929 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF56Q15929 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms