Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLF9Q13886 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms