Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTP4A2Q12974 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTP4A2Q12974 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTP4A2Q12974 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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