Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RELNP78509 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELNP78509 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELNP78509 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELNP78509 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELNP78509 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELNP78509 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELNP78509 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RELNP78509 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELNP78509 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELNP78509 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELNP78509 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELNP78509 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELNP78509 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELNP78509 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELNP78509 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELNP78509 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RELNP78509 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RELNP78509 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELNP78509 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELNP78509 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELNP78509 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RELNP78509 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELNP78509 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELNP78509 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELNP78509 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELNP78509 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELNP78509 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELNP78509 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELNP78509 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELNP78509 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELNP78509 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELNP78509 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELNP78509 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELNP78509 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELNP78509 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELNP78509 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELNP78509 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELNP78509 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELNP78509 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELNP78509 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RELNP78509 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELNP78509 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELNP78509 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELNP78509 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELNP78509 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELNP78509 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELNP78509 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELNP78509 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELNP78509 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RELNP78509 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELNP78509 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELNP78509 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELNP78509 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELNP78509 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELNP78509 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RELNP78509 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELNP78509 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELNP78509 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELNP78509 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELNP78509 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELNP78509 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RELNP78509 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RELNP78509 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RELNP78509 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RELNP78509 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELNP78509 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RELNP78509 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELNP78509 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELNP78509 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RELNP78509 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELNP78509 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RELNP78509 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RELNP78509 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RELNP78509 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RELNP78509 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RELNP78509 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RELNP78509 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RELNP78509 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RELNP78509 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RELNP78509 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms