Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PMS1P54277 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PMS1P54277 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PMS1P54277 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PMS1P54277 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PMS1P54277 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PMS1P54277 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMS1P54277 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMS1P54277 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMS1P54277 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMS1P54277 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMS1P54277 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMS1P54277 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMS1P54277 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMS1P54277 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PMS1P54277 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMS1P54277 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMS1P54277 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMS1P54277 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMS1P54277 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMS1P54277 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMS1P54277 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMS1P54277 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMS1P54277 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMS1P54277 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMS1P54277 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMS1P54277 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMS1P54277 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMS1P54277 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMS1P54277 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMS1P54277 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMS1P54277 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMS1P54277 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMS1P54277 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMS1P54277 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMS1P54277 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMS1P54277 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMS1P54277 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS1P54277 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMS1P54277 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMS1P54277 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMS1P54277 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS1P54277 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS1P54277 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS1P54277 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS1P54277 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS1P54277 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS1P54277 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS1P54277 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS1P54277 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS1P54277 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS1P54277 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS1P54277 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS1P54277 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS1P54277 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS1P54277 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS1P54277 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PMS1P54277 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMS1P54277 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMS1P54277 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMS1P54277 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMS1P54277 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMS1P54277 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS1P54277 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS1P54277 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS1P54277 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS1P54277 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS1P54277 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMS1P54277 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMS1P54277 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMS1P54277 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMS1P54277 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMS1P54277 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS1P54277 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS1P54277 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS1P54277 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS1P54277 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS1P54277 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS1P54277 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS1P54277 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS1P54277 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 590.6 ms