Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SUB1P53999 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.265e-9■■■■■ 42.5
SUB1P53999 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.38e-9■■■■■ 42.5
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SUB1P53999 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.368e-9■■■■■ 42.5
SUB1P53999 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.368e-9■■■■■ 42.5
SUB1P53999 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.387e-8■■■■■ 42.5
SUB1P53999 DNAJB11-204ENST00000495390 4079 ntTSL 26.18□□□□□ -1.425e-9■■■■■ 42.5
SUB1P53999 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.525e-9■■■■■ 42.5
SUB1P53999 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.537e-8■■■■■ 42.5
SUB1P53999 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.567e-8■■■■■ 42.5
SUB1P53999 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.64e-33■■■■■ 42.5
SUB1P53999 NIPSNAP2-211ENST00000497279 4255 ntTSL 24.19□□□□□ -1.745e-9■■■■■ 42.5
SUB1P53999 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.117e-9■■■■■ 42.3
SUB1P53999 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.663e-10■■■■■ 42.3
SUB1P53999 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 42.3
SUB1P53999 ARPC1B-220ENST00000491294 1051 ntTSL 513.24□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 42.3
SUB1P53999 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 42.3
SUB1P53999 ARPC1B-217ENST00000481997 945 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 42.3
SUB1P53999 ARPC1B-214ENST00000463078 537 ntTSL 311.2□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 42.3
SUB1P53999 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 42.3
SUB1P53999 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.579e-7■■■■■ 42.3
SUB1P53999 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 42.3
SUB1P53999 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.779e-7■■■■■ 42.3
SUB1P53999 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.117e-11■■■■■ 42.3
SUB1P53999 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.817e-11■■■■■ 42.3
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