RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261660.4

CPPED1-201, Transcript of calcineurin like phosphoesterase domain containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CPPED1, Length 1,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1-201ENST00000261660 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.54■■■□□ 2.8
CPPED1-201ENST00000261660 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.8■■■□□ 2.2
CPPED1-201ENST00000261660 ABCC9O60706 1549 aa27.82■■■□□ 2.04
CPPED1-201ENST00000261660 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CPPED1-201ENST00000261660 NACADO15069 1562 aa27.01■■□□□ 1.91
CPPED1-201ENST00000261660 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.99■■□□□ 1.91
CPPED1-201ENST00000261660 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.99■■□□□ 1.91
CPPED1-201ENST00000261660 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.98■■□□□ 1.91
CPPED1-201ENST00000261660 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.95■■□□□ 1.91
CPPED1-201ENST00000261660 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.27■■□□□ 1.8
CPPED1-201ENST00000261660 SCRIBQ14160 1630 aa26.26■■□□□ 1.79
CPPED1-201ENST00000261660 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.09■■□□□ 1.77
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CPPED1-201ENST00000261660 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.94■■□□□ 1.74
CPPED1-201ENST00000261660 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CPPED1-201ENST00000261660 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.28■■□□□ 1.64
CPPED1-201ENST00000261660 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CPPED1-201ENST00000261660 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.2■■□□□ 1.62
CPPED1-201ENST00000261660 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.19■■□□□ 1.62
CPPED1-201ENST00000261660 SMARCA4P51532 1647 aa25.17■■□□□ 1.62
CPPED1-201ENST00000261660 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.06■■□□□ 1.6
CPPED1-201ENST00000261660 SMARCA2P51531 1590 aa24.97■■□□□ 1.59
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CPPED1-201ENST00000261660 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.95■■□□□ 1.58
CPPED1-201ENST00000261660 NCAPD3P42695 1498 aa24.92■■□□□ 1.58
CPPED1-201ENST00000261660 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CPPED1-201ENST00000261660 HMGXB3Q12766 1538 aa24.83■■□□□ 1.57
CPPED1-201ENST00000261660 WIZO95785 1651 aa24.79■■□□□ 1.56
CPPED1-201ENST00000261660 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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CPPED1-201ENST00000261660 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CPPED1-201ENST00000261660 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.28■■□□□ 1.48
CPPED1-201ENST00000261660 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.2■■□□□ 1.47
CPPED1-201ENST00000261660 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.2■■□□□ 1.46
CPPED1-201ENST00000261660 NESP48681 1621 aa24.16■■□□□ 1.46
CPPED1-201ENST00000261660 CFTRP13569 1480 aa24.13■■□□□ 1.45
CPPED1-201ENST00000261660 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.03■■□□□ 1.44
CPPED1-201ENST00000261660 ERCC6Q03468 1493 aa23.98■■□□□ 1.43
CPPED1-201ENST00000261660 PRDM2Q13029 1718 aa23.94■■□□□ 1.42
CPPED1-201ENST00000261660 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.91■■□□□ 1.42
CPPED1-201ENST00000261660 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.91■■□□□ 1.42
CPPED1-201ENST00000261660 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.88■■□□□ 1.41
CPPED1-201ENST00000261660 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.86■■□□□ 1.41
CPPED1-201ENST00000261660 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.76■■□□□ 1.39
CPPED1-201ENST00000261660 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CPPED1-201ENST00000261660 WDR62O43379 1518 aa23.67■■□□□ 1.38
CPPED1-201ENST00000261660 CUX2O14529 1486 aa23.64■■□□□ 1.38
CPPED1-201ENST00000261660 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CPPED1-201ENST00000261660 ABCC8Q09428 1581 aa23.62■■□□□ 1.37
CPPED1-201ENST00000261660 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.58■■□□□ 1.36
CPPED1-201ENST00000261660 TOPBP1Q92547 1522 aa23.57■■□□□ 1.36
CPPED1-201ENST00000261660 CUX1P39880 1505 aa23.5■■□□□ 1.35
CPPED1-201ENST00000261660 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
CPPED1-201ENST00000261660 TOP2BQ02880 1626 aa23.4■■□□□ 1.34
CPPED1-201ENST00000261660 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.39■■□□□ 1.33
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CPPED1-201ENST00000261660 SYNJ1O43426 1573 aa23.38■■□□□ 1.33
CPPED1-201ENST00000261660 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.37■■□□□ 1.33
CPPED1-201ENST00000261660 IFT140Q96RY7 1462 aa23.36■■□□□ 1.33
CPPED1-201ENST00000261660 SOGA1O94964 1423 aa23.29■■□□□ 1.32
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CPPED1-201ENST00000261660 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.25■■□□□ 1.31
CPPED1-201ENST00000261660 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.18■■□□□ 1.3
CPPED1-201ENST00000261660 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CPPED1-201ENST00000261660 WDR97A6NE52 1622 aa23.17■■□□□ 1.3
CPPED1-201ENST00000261660 TRIM41Q8WV44 630 aa23.13■■□□□ 1.29
CPPED1-201ENST00000261660 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CPPED1-201ENST00000261660 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CPPED1-201ENST00000261660 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
CPPED1-201ENST00000261660 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.05■■□□□ 1.28
CPPED1-201ENST00000261660 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.04■■□□□ 1.28
CPPED1-201ENST00000261660 GRIN2BQ13224 1484 aa23■■□□□ 1.27
CPPED1-201ENST00000261660 KIF27Q86VH2 1401 aa22.99■■□□□ 1.27
CPPED1-201ENST00000261660 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.97■■□□□ 1.27
CPPED1-201ENST00000261660 PBRM1Q86U86 1689 aa22.94■■□□□ 1.26
CPPED1-201ENST00000261660 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CPPED1-201ENST00000261660 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.92■■□□□ 1.26
CPPED1-201ENST00000261660 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.91■■□□□ 1.26
CPPED1-201ENST00000261660 IGF1RP08069 1367 aa22.83■■□□□ 1.24
CPPED1-201ENST00000261660 SYNJ2O15056 1496 aa22.81■■□□□ 1.24
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CPPED1-201ENST00000261660 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.8■■□□□ 1.24
CPPED1-201ENST00000261660 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.8■■□□□ 1.24
CPPED1-201ENST00000261660 EEA1Q15075 1411 aa22.79■■□□□ 1.24
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CPPED1-201ENST00000261660 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CPPED1-201ENST00000261660 FBLN2P98095 1184 aa22.74■■□□□ 1.23
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CPPED1-201ENST00000261660 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.7■■□□□ 1.22
CPPED1-201ENST00000261660 OSCARQ8IYS5 282 aa22.69■■□□□ 1.22
CPPED1-201ENST00000261660 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.66■■□□□ 1.22
CPPED1-201ENST00000261660 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.64■■□□□ 1.21
CPPED1-201ENST00000261660 PRXQ9BXM0 1461 aa22.62■■□□□ 1.21
CPPED1-201ENST00000261660 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.61■■□□□ 1.21
CPPED1-201ENST00000261660 HRCP23327 699 aa22.6■■□□□ 1.21
CPPED1-201ENST00000261660 NUP160Q12769 1436 aa22.6■■□□□ 1.21
CPPED1-201ENST00000261660 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CPPED1-201ENST00000261660 CEP170Q5SW79 1584 aa22.55■■□□□ 1.2
CPPED1-201ENST00000261660 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.54■■□□□ 1.2
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