Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC43.51■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SMARCA4P51532 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SMARCA4P51532 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
SMARCA4P51532 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SMARCA4P51532 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SMARCA4P51532 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms