Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA6P31267 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA6P31267 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms