Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP1P23763 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms