Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1P21675 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1P21675 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1P21675 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1P21675 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1P21675 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1P21675 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1P21675 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1P21675 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1P21675 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF1P21675 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1P21675 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1P21675 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1P21675 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1P21675 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1P21675 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1P21675 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1P21675 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1P21675 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1P21675 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1P21675 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1P21675 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1P21675 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1P21675 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1P21675 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1P21675 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1P21675 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1P21675 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1P21675 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1P21675 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1P21675 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1P21675 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1P21675 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1P21675 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1P21675 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1P21675 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1P21675 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1P21675 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1P21675 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1P21675 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1P21675 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1P21675 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1P21675 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1P21675 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1P21675 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1P21675 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1P21675 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1P21675 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1P21675 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF1P21675 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF1P21675 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1P21675 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1P21675 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1P21675 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1P21675 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1P21675 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1P21675 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1P21675 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1P21675 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1P21675 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1P21675 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1P21675 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1P21675 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1P21675 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1P21675 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1P21675 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1P21675 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1P21675 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1P21675 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1P21675 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TAF1P21675 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms