Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA6P17658 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KCNA6P17658 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KCNA6P17658 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KCNA6P17658 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KCNA6P17658 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KCNA6P17658 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
KCNA6P17658 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KCNA6P17658 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KCNA6P17658 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KCNA6P17658 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KCNA6P17658 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
KCNA6P17658 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KCNA6P17658 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KCNA6P17658 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KCNA6P17658 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KCNA6P17658 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
KCNA6P17658 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.79■■■■□ 3
KCNA6P17658 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KCNA6P17658 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KCNA6P17658 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
KCNA6P17658 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KCNA6P17658 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KCNA6P17658 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KCNA6P17658 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KCNA6P17658 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KCNA6P17658 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
KCNA6P17658 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.77■■■■□ 3
KCNA6P17658 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KCNA6P17658 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
KCNA6P17658 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KCNA6P17658 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms