Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM10L1P0DMW3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM10L1P0DMW3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10L1P0DMW3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms