Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VIL1P09327 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VIL1P09327 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VIL1P09327 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VIL1P09327 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VIL1P09327 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VIL1P09327 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VIL1P09327 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VIL1P09327 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VIL1P09327 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VIL1P09327 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
VIL1P09327 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
VIL1P09327 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VIL1P09327 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VIL1P09327 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VIL1P09327 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VIL1P09327 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VIL1P09327 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VIL1P09327 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VIL1P09327 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VIL1P09327 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VIL1P09327 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VIL1P09327 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VIL1P09327 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VIL1P09327 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VIL1P09327 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VIL1P09327 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VIL1P09327 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VIL1P09327 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VIL1P09327 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VIL1P09327 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VIL1P09327 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VIL1P09327 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VIL1P09327 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VIL1P09327 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VIL1P09327 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VIL1P09327 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VIL1P09327 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VIL1P09327 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VIL1P09327 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VIL1P09327 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VIL1P09327 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VIL1P09327 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VIL1P09327 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VIL1P09327 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
VIL1P09327 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VIL1P09327 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VIL1P09327 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VIL1P09327 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VIL1P09327 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VIL1P09327 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VIL1P09327 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VIL1P09327 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
VIL1P09327 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VIL1P09327 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VIL1P09327 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VIL1P09327 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VIL1P09327 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VIL1P09327 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VIL1P09327 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VIL1P09327 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VIL1P09327 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VIL1P09327 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VIL1P09327 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VIL1P09327 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VIL1P09327 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VIL1P09327 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VIL1P09327 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VIL1P09327 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VIL1P09327 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VIL1P09327 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VIL1P09327 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VIL1P09327 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VIL1P09327 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VIL1P09327 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VIL1P09327 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VIL1P09327 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VIL1P09327 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VIL1P09327 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VIL1P09327 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VIL1P09327 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VIL1P09327 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VIL1P09327 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VIL1P09327 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VIL1P09327 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VIL1P09327 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VIL1P09327 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VIL1P09327 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VIL1P09327 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VIL1P09327 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VIL1P09327 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VIL1P09327 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VIL1P09327 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VIL1P09327 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VIL1P09327 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VIL1P09327 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VIL1P09327 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VIL1P09327 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VIL1P09327 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VIL1P09327 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms