Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS17P08708 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS17P08708 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS17P08708 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS17P08708 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS17P08708 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS17P08708 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS17P08708 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS17P08708 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS17P08708 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS17P08708 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS17P08708 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS17P08708 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS17P08708 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS17P08708 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS17P08708 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS17P08708 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS17P08708 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS17P08708 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS17P08708 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS17P08708 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS17P08708 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS17P08708 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS17P08708 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS17P08708 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS17P08708 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS17P08708 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS17P08708 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS17P08708 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS17P08708 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS17P08708 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS17P08708 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS17P08708 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS17P08708 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS17P08708 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS17P08708 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS17P08708 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS17P08708 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS17P08708 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS17P08708 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS17P08708 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS17P08708 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS17P08708 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS17P08708 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS17P08708 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS17P08708 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS17P08708 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS17P08708 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS17P08708 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS17P08708 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS17P08708 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS17P08708 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS17P08708 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS17P08708 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS17P08708 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS17P08708 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS17P08708 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS17P08708 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS17P08708 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS17P08708 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS17P08708 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS17P08708 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS17P08708 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS17P08708 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS17P08708 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS17P08708 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS17P08708 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS17P08708 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS17P08708 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS17P08708 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS17P08708 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS17P08708 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS17P08708 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS17P08708 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS17P08708 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS17P08708 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS17P08708 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS17P08708 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS17P08708 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS17P08708 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS17P08708 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS17P08708 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS17P08708 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS17P08708 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS17P08708 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS17P08708 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS17P08708 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms