Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-CO1P00395 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MT-CO1P00395 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-CO1P00395 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms