Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM1O75626 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRDM1O75626 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM1O75626 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms