Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA3O75145 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms