Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SYNJ1O43426 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNJ1O43426 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
SYNJ1O43426 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
SYNJ1O43426 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNJ1O43426 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms