Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC27A2O14975 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A2O14975 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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