Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
POLRMTO00411 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLRMTO00411 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLRMTO00411 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
POLRMTO00411 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms