Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCRIP1C9JLW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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