Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM223BA6NKX1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM223BA6NKX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM223BA6NKX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms