Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KQE9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KQE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KQE9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KQE9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KQE9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KQE9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KQE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KQE9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KQE9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KQE9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U3KQE9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
U3KQE9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U3KQE9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
U3KQE9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
U3KQE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U3KQE9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U3KQE9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U3KQE9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U3KQE9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U3KQE9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U3KQE9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
U3KQE9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
U3KQE9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U3KQE9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
U3KQE9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U3KQE9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
U3KQE9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
U3KQE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
U3KQE9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U3KQE9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U3KQE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U3KQE9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U3KQE9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
U3KQE9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
U3KQE9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQE9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQE9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQE9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQE9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQE9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQE9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQE9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQE9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQE9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQE9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQE9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQE9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQE9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQE9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
U3KQE9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
U3KQE9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQE9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQE9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQE9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQE9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQE9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQE9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQE9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQE9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms