Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQA8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQA8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQA8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQA8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQA8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQA8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQA8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQA8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQA8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U3KQA8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQA8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQA8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQA8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQA8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQA8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQA8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQA8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQA8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQA8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQA8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQA8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQA8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQA8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQA8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQA8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQA8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQA8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQA8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQA8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQA8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQA8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQA8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQA8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQA8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQA8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQA8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQA8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQA8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQA8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQA8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQA8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQA8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQA8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQA8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQA8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQA8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQA8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQA8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQA8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQA8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQA8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U3KQA8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
U3KQA8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U3KQA8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U3KQA8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U3KQA8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U3KQA8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U3KQA8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQA8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQA8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQA8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQA8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQA8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQA8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQA8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQA8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQA8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQA8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQA8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQA8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U3KQA8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQA8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQA8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQA8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQA8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQA8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQA8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.3 ms