Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KL1Q9Y6S9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KL1Q9Y6S9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms