Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC6Q9Y625 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC6Q9Y625 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms